在究极绿宝石5.3精灵的分布中，大致分为以下几个情况。首先是御三家系列，玩家在选择之后，前期的地图中无法遇到其他世代的御三家，，二周目以后才能接触到后面的御三家。其次，宝可梦种类由于高达八百多种。所以对种类情况大致分为以下几种：
草丛是玩家们最先接触的地方，在这些草丛中玩家们可以遇到各式各样的常见宝可梦，它们大多都是以草系，虫系和一般系为主，个别的草丛里还有着设定为1%概率出现的稀有宝可梦，这就需要大家自己去探索。
想要捕捉水系宝可梦，那么就需要获得钓竿来钓取获得。或者在后期的剧情中获得冲浪术自己下水，那么想要什么样的水系宝可梦都有了。同理，一些稀有的宝可梦都会在不同水域里以极低的概率出现，至于遇到最多的则是鲤鱼王，玛瑙水母这种居多。
对于一些特殊的宝可梦，比如说幽灵系列那就需要特定的游戏场景里才会有。游戏中大家可以在送神火山那里遇到很多不同的幽灵系宝可梦。想要电系可以到新紫瑾市场景中来探索，而喜欢龙系的也有着专门的地方流星瀑布！
在洞窟的场景之下，玩家们遇到最多的就是岩石地面系居多，当然还有那位洞窟的老常客超音蝠！除了有着岩石地面系的分布，格斗系也是被设定在这个场景之中，大家熟知的怪力，飞腿郎等等都可以在这里找到答案。
最后就是游戏中最强大的神兽分布了，这里就很笼统了，几乎厉害的一级神，每一位都有着特定的出场方式，区域也是各不相同。而且游戏中每一位神兽也就只要一只，如果你打败没有收服的话那就没有啦，一定要非常慎重。
